自然流产必须先判断宫内妊娠是否正常，也就是B超检查宫腔内是否存在胎囊并可见到卵黄囊时，有些病人可见到胎心。
正常宫内妊娠时，病人如有下腹部的疼痛渐增，由不连续的疼痛渐至持续性疼痛、阴道流血、肉样组织排出及局部血块等，可见到一团团绒绒组织，也就是绒毛，伴随着出血渐少，痛苦渐轻，这一过程就是自然流产。
判定自然流产的方法有二：
首先，若病人已被确认为宫内妊娠时，彩超可看到宫腔内的孕囊。 此种情况的病人有阴道流血的现象，可根据彩超判断有无自然流产的现象。复查彩超，观察病人宫腔内的孕囊已排出体外，即可确诊自然流产。
二是若仅从血HCG检查确定是妊娠，彩超未查到孕囊且病人有阴道流血时，仅能根据血HCG改变来确定是自然流产。病人出血时及出血后血HCG水平急剧下降并逐渐降低到正常水平可判定为自然流产又称生化妊娠。 在不断监测HCG改变的同时，也需定期观彩超以排除宫外孕。
评判流产与月经的标准有以下几点：
1、观察出血时间;若来经，出血时间与前一次月经有周期，通常刚好1个月左右。 而若为流产者则通常出现月经推迟。
2、出血多少;正常月经在第1天月经较少，第2天月经较多，在第3天和第4天月经减少，之后月经就会慢慢变得清洁。 且出现先兆流产者，出血相对较少，始终有棕色分泌物。
3、最简便直接的办法是制作尿试纸;若尿试纸检测结果为阳性，则提示流产； 若尿化验结果为阴性，那么就是有更多的机会来月经了。
4、怀孕后雌孕激素和HCG水平较高，病人多出现恶心呕吐等早孕反应而月经一般无。