妊娠时流出棕色的血液可为生化妊娠或宫外孕，宫颈疾病和着床出血，有好有坏，因此许多我们都要从各方面综合考虑才能作出确切判断。
1.生化妊娠
生化妊娠又可称为亚临床流产（简称隐性流产），多因精子与卵子已形成受精卵但未能顺利地着床于孕妈子宫所致，但经各项检测, HCG符合妊娠表现，但HCG晚期下降并不上升，且行超声等检查均不能找到妊娠囊，这类早期妊娠六周不成功称为生化妊娠。
生化妊娠可有大量褐色分泌物出现，可有腹痛。 生化妊娠通常出现多为胚胎自身质量差，或受精卵有偶然性染色体变异或天然优胜劣汰。 建议对双方进行染色体检查以排除遗传等影响。
2.宫外孕
此种属精子与卵子结成受精卵，亦顺利着床，但着床部位错误，为非子宫内异位妊娠，属妇科危险急腹症之一，须引起高度重视！ 宫外孕有一个表现，即有褐色分泌物，腹痛并不断加剧。
3.宫颈疾病
如果孕妈患有宫颈之类的病症，如患有宫颈外翻，宫颈息肉，宫颈糜烂等等，就可能导致孕妈怀孕之后，分泌褐色血，这类病症若不治好，就可能伴随着整个怀孕期间，或造成流产等等。
4.着床出血
着床出血是受精卵在宫内正常妊娠，但由于受精卵黏附于子宫内膜着床于子宫内膜时引起，此算生理性表现，为妊娠信号。 但着床出血总是较少，色彩多为粉色或褐色，红色发生概率很低。 会伴轻度腹痛但不剧烈加重。
孕期如有流出褐色血，应及时到医院作B超检查，如证实为宫内妊娠，则应进一步抽血检查HCG,孕酮及雌二醇，必要时尽早保胎，如肌注黄体酮阴道缓释凝胶及口服天然维生素E及安胎丸，并尽可能卧床休息及尽可能少动。